ROMUALDI, CHIARA
ROMUALDI, CHIARA
Dipartimento di Biologia - DiBio
Baseline levels and dynamic changes of cfDNA, tumor fraction and mutations to anticipate the clinical course of small cell lung cancer (SCLC) patients treated with first-line atezolizumab and chemotherapy: an hypothesis generating study (CATS/ML43257)
2025 Pasello, Giulia; Pigato, Giulia; Scattolin, Daniela; Lando, Stefania; Potente, Sara; Romualdi, Chiara; Roma, Anna; Resi, Maria Vittoria; Frega, Stefano; Ferro, Alessandra; Maso, Alessandro Dal; Bonanno, Laura; Guarneri, Valentina; Lazzarini, Elisabetta; Indraccolo, Stefano
HR-SC-an academic-developed machine learning framework to classify HRD-positive ovarian cancer patients and predict sensitivity to olaparib
2025 Beltrame, L; Mannarino, L; Sergi, A; Velle, A; Treilleux, I; Pignata, S; Paracchini, L; Harter, P; Scambia, G; Perrone, F; González-Martin, A; Berger, R; Arenare, L; Hietanen, S; Califano, D; Derio, S; Van Gorp, T; Dalessandro, M L; Fujiwara, K; Provansal, M; Lorusso, D; Buderath, P; Masseroli, M; Ray-Coquard, I; Pujade-Lauraine, E; Romualdi, C; D'Incalci, M; Marchini, S
Marigold and MitoCIAO, two searchable compendia to visualize and functionalize protein complexes during mitochondrial remodeling
2025 Rigoni, Giovanni; Calvo, Enrique; Glytsou, Christina; Carro-Alvarellos, Marta; Noguchi, Masafumi; Semenzato, Martina; Quirin, Charlotte; Caicci, Federico; Meneghetti, Natascia; Sturlese, Mattia; Ishihara, Takaya; Moro, Stefano; Rampazzo, Chiara; Ishihara, Naotada; Bezzo, Fabrizio; Salviati, Leonardo; Vazquez, Jesùs; Sales, Gabriele; Romualdi, Chiara; Antonio Enriquez, Jose; Scorrano, Luca; SORIANO GARCIA - CUERVA, MARIA EUGENIA
SAMURAI: shallow analysis of copy number alterations using a reproducible and integrated bioinformatics pipeline
2025 Potente, S.; Boscarino, D.; Paladin, D.; Marchini, S.; Beltrame, L.; Romualdi, C.
Somatic Copy Number Alterations in Circulating Cell-Free DNA as a Prognostic Biomarker for Hepatocellular Carcinoma: Insights from a Proof-of-Concept Study
2025 Pinto, Elisa; Lazzarini, Elisabetta; Pelizzaro, Filippo; Gambato, Martina; Santarelli, Laura; Potente, Sara; Zanaga, Paola; Zappitelli, Teresa; Cardin, Romilda; Burra, Patrizia; Farinati, Fabio; Romualdi, Chiara; Boscarino, Diego; Tosello, Valeria; Indraccolo, Stefano; Russo, Francesco Paolo
A mitochondrial NADPH-cholesterol axis regulates extracellular vesicle biogenesis to support hematopoietic stem cell fate
2024 Bonora, Massimo; Morganti, Claudia; van Gastel, Nick; Ito, Kyoko; Calura, Enrica; Zanolla, Ilaria; Ferroni, Letizia; Zhang, Yang; Jung, Yookyung; Sales, Gabriele; Martini, Paolo; Nakamura, Takahisa; Lasorsa, Francesco Massimo; Finkel, Toren; Lin, Charles P; Zavan, Barbara; Pinton, Paolo; Georgakoudi, Irene; Romualdi, Chiara; Scadden, David T; Ito, Keisuke
BioID-based intact cell interactome of the Kv1.3 potassium channel identifies a Kv1.3-STAT3-p53 cellular signaling pathway
2024 Prosdocimi, E.; Carpanese, V.; Todesca, L. M.; Varanita, T.; Bachmann, M.; Festa, M.; Bonesso, D.; Perez-Verdaguer, M.; Carrer, A.; Velle, A.; Peruzzo, R.; Muccioli, S.; Doni, D.; Leanza, L.; Costantini, P.; Stein, F.; Rettel, M.; Felipe, A.; Edwards, M. J.; Gulbins, E.; Cendron, L.; Romualdi, C.; Checchetto, V.; Szabo, I.
Exploring public cancer gene expression signatures across bulk, single-cell and spatial transcriptomics data with signifinder Bioconductor package
2024 Pirrotta, Stefania; Masatti, Laura; Bortolato, Anna; Corrà, Anna; Pedrini, Fabiola; Aere, Martina; Esposito, Giovanni; Martini, Paolo; Risso, Davide; Romualdi, Chiara; Calura, Enrica
Interactomic exploration of LRRC8A in volume-regulated anion channels.
2024 Carpanese, Veronica; Festa, Margherita; Prosdocimi, Elena; Bachmann, Magdalena; Sadeghi, Soha; Bertelli, Sara; Stein, Frank; Velle, Angelo; Abdel-Salam, Mostafa A. L.; Romualdi, Chiara; Pusch, Michael; Checchetto, Vanessa
A comprehensive investigation of histotype-specific microRNA and their variants in Stage I epithelial ovarian cancers
2023 Velle, A.; Pesenti, C.; Grassi, T.; Beltrame, L.; Martini, P.; Jaconi, M.; Agostinis, F.; Calura, E.; Katsaros, D.; Borella, F.; Fruscio, R.; D'Incalci, M.; Marchini, S.; Romualdi, C.
A pan-cancer landscape of pathogenic somatic copy number variations
2023 Becchi, Tommaso; Beltrame, Luca; Mannarino, Laura; Calura, Enrica; Marchini, Sergio; Romualdi, Chiara
benchdamic: benchmarking of differential abundance methods for microbiome data
2023 Calgaro, Matteo; Romualdi, Chiara; Risso, Davide; Vitulo, Nicola
Defective excitation-contraction coupling and mitochondrial respiration precede mitochondrial Ca2+ accumulation in spinobulbar muscular atrophy skeletal muscle
2023 Marchioretti, Caterina; Zanetti, Giulia; Pirazzini, Marco; Gherardi, Gaia; Nogara, Leonardo; Andreotti, Roberta; Martini, Paolo; Marcucci, Lorenzo; Canato, Marta; R Nath, Samir; Zuccaro, Emanuela; Chivet, Mathilde; Mammucari, Cristina; Pacifici, Marco; Raffaello, Anna; Rizzuto, Rosario; Mattarei, Andrea; Desbats, Maria Andrea; Salviati, Leonardo; Megighian, Aram; Sorarù, Gianni; Pegoraro, Elena; Belluzzi, Elisa; Pozzuoli, Assunta; Biz, Carlo; Ruggieri, Pietro; Romualdi, Chiara; P Lieberman, Andrew; J Babu, Gopal; Sandri, Marco; Blaauw, Bert; Basso, Manuela; Pennuto, Maria
Genome-wide profiling of patient-derived glioblastoma stem-like cells reveals recurrent genetic and transcriptomic signatures associated with brain tumors
2023 Lazzarini, E.; Silvestris, D. A.; Benvenuto, G.; Osti, D.; Fattore, L.; Paterra, R.; Finocchiaro, G.; Malatesta, P.; Daga, A.; Gallotti, A. L.; Galli, R.; Pelicci, G.; Tesei, A.; Bedeschi, M.; Pallini, R.; Pasqualini, L.; Romualdi, C.; Gallo, A.; Ricci-Vitiani, L.; Indraccolo, S.
Genomic instability analysis in DNA from Papanicolaou test provides proof-of-principle early diagnosis of high-grade serous ovarian cancer
2023 Paracchini, Lara; Mannarino, Laura; Romualdi, Chiara; Zadro, Riccardo; Beltrame, Luca; Fuso Nerini, Ilaria; Zola, Paolo; Laudani, Maria E; Pagano, Eva; Giordano, Livia; Fruscio, Robert; Landoni, Fabio; Franceschi, Silvia; Dalessandro, Maria L; Canzonieri, Vincenzo; Bocciolone, Luca; Lorusso, Domenica; Bosetti, Cristina; Raspagliesi, Francesco; Garassino, Isabella M G; D'Incalci, Maurizio; Marchini, Sergio
Spatial compartmentalization of signaling imparts source-specific functions on secreted factors
2023 Groppa, E.; Martini, P.; Derakhshan, N.; Theret, M.; Ritso, M.; Tung, L. W.; Wang, Y. X.; Soliman, H.; Hamer, M. S.; Stankiewicz, L.; Eisner, C.; Erwan, L. N.; Chang, C.; Yi, L.; Yuan, J. H.; Kong, S.; Weng, C.; Adams, J.; Chang, L.; Peng, A.; Blau, H. M.; Romualdi, C.; Rossi, F. M. V.
Transglutaminase Type 2-MITF axis regulates phenotype switching in skin cutaneous melanoma
2023 Muccioli, Silvia; Brillo, Valentina; Varanita, Tatiana; Rossin, Federica; Zaltron, Elisabetta; Velle, Angelo; Alessio, Giorgia; Angi, Beatrice; Severin, Filippo; Tosi, Anna; D'Eletto, Manuela; Occhigrossi, Luca; Falasca, Laura; Checchetto, Vanessa; Ciaccio, Roberto; Fascì, Amelia; Chieregato, Leonardo; Rebelo, Ana Paula; Giacomello, Marta; Rosato, Antonio; Szabò, Ildikò; Romualdi, Chiara; Piacentini, Mauro; Leanza, Luigi
A thorough annotation of the krill transcriptome offers new insights for the study of physiological processes
2022 Urso, Ilenia; Biscontin, Alberto; Corso, Davide; Bertolucci, Cristiano; Romualdi, Chiara; De Pittà, Cristiano; Meyer, Bettina; Sales, Gabriele
BrewerIX enables allelic expression analysis of imprinted and X-linked genes from bulk and single-cell transcriptomes
2022 Martini, P.; Sales, G.; Diamante, L.; Perrera, V.; Colantuono, C.; Riccardo, S.; Cacchiarelli, D.; Romualdi, C.; Martello, G.
Copy number alterations in stage I epithelial ovarian cancer highlight three genomic patterns associated with prognosis
2022 Pesenti, C.; Beltrame, L.; Velle, A.; Fruscio, R.; Jaconi, M.; Borella, F.; Cribiu, F. M.; Calura, E.; Venturini, L. V.; Lenoci, D.; Agostinis, F.; Katsaros, D.; Panini, N.; Bianchi, T.; Landoni, F.; Miozzo, M.; D'Incalci, M.; Brenton, J. D.; Romualdi, C.; Marchini, S.