TOPPO, STEFANO
TOPPO, STEFANO
Dipartimento di Medicina Molecolare - DMM
Viral Network Analyzer (VirNA): A Novel Minimum Spanning Networks Algorithm for Investigating Viral Evolution
2025 Mazzotti, Giorgia; Bianco, Luca; Lavezzo, Enrico; Bado, Martina; Toppo, Stefano; Fontana, Paolo
Immune System Deficiencies Do Not Alter SARS-CoV-2 Evolutionary Rate but Favour the Emergence of Mutations by Extending Viral Persistence
2024 Manuto, L.; Bado, M.; Cola, M.; Vanzo, E.; Antonello, M.; Mazzotti, G.; Pacenti, M.; Cordioli, G.; Sasset, L.; Cattelan, A. M.; Toppo, S.; Lavezzo, E.
An Overview of Protein Function Prediction Methods: A Deep Learning Perspective
2023 Ispano, E.; Bianca, F.; Lavezzo, E.; Toppo, S.
FunTaxIS-lite: a simple and light solution to investigate protein functions in all living organisms
2023 Bianca, Federico; Ispano, Emilio; Gazzola, Ermanno; Lavezzo, Enrico; Fontana, Paolo; Toppo, Stefano
Role of the Extracytoplasmic Function Sigma Factor SigE in the Stringent Response of Mycobacterium tuberculosis
2023 Baruzzo, Giacomo; Serafini, Agnese; Finotello, Francesca; Sanavia, Tiziana; Cioetto-Mazzabò, Laura; Boldrin, Francesca; Lavezzo, Enrico; Barzon, Luisa; Toppo, Stefano; Provvedi, Roberta; Manganelli, Riccardo; Di Camillo, Barbara
A Circadian Hygiene Education Initiative Covering the Pre-pandemic and Pandemic Period Resulted in Earlier Get-Up Times in Italian University Students: An Ecological Study
2022 Montagnese, Sara; Zarantonello, Lisa; Formentin, Chiara; Giusti, Gianluca; Mangini, Chiara; Isherwood, Cheryl M.; Ferrari, Paolo; Paoli, Antonio; Mapelli, Daniela; Rizzuto, Rosario; Toppo, Stefano; Skene, Debra J.; Vettor, Roberto; Costa, Rodolfo
A white paper on Phospholipid Hydroperoxide Glutathione Peroxidase (GPx4) forty years later
2022 Ursini, F.; Bosello Travain, V.; Cozza, G.; Miotto, G.; Roveri, A.; Toppo, S.; Maiorino, M.
Human Virus Genomes Are Enriched in Conserved Adenine/Thymine/Uracil Multiple Tracts That Pause Polymerase Progression
2022 Ruggiero, Emanuela; Lavezzo, Enrico; Grazioli, Marco; Zanin, Irene; Marušič, Maja; Plavec, Janez; Richter, Sara N; Toppo, Stefano
Impact of antigen test target failure and testing strategies on the transmission of SARS-CoV-2 variants
2022 Del Vecchio, Claudia; Cracknell Daniels, Bethan; Brancaccio, Giuseppina; Brazzale, Alessandra Rosalba; Lavezzo, Enrico; Ciavarella, Constanze; Onelia, Francesco; Franchin, Elisa; Manuto, Laura; Bianca, Federico; Cianci, Vito; Cattelan, Anna Maria; Dorigatti, Ilaria; Toppo, Stefano; Crisanti, Andrea
Longitudinal analysis of T cell receptor repertoires reveals shared patterns of antigen-specific response to SARS-CoV-2 infection
2022 Gittelman, R. M.; Lavezzo, E.; Snyder, T. M.; Zahid, H. J.; Carty, C. L.; Elyanow, R.; Dalai, S.; Kirsch, I.; Baldo, L.; Manuto, L.; Franchin, E.; Del Vecchio, C.; Pacenti, M.; Boldrin, C.; Cattai, M.; Saluzzo, F.; Padoan, A.; Plebani, M.; Simeoni, F.; Bordini, J.; Lore, N. I.; Lazarevic, D.; Cirillo, D. M.; Ghia, P.; Toppo, S.; Carlson, J. M.; Robins, H. S.; Crisanti, A.; Tonon, G.
Neutralising reactivity against SARS-CoV-2 Delta and Omicron variants by vaccination and infection history
2022 Lavezzo, E.; Pacenti, M.; Manuto, L.; Boldrin, C.; Cattai, M.; Grazioli, M.; Bianca, F.; Sartori, M.; Caldart, F.; Castelli, G.; Nicoletti, M.; Nieddu, E.; Salvadoretti, E.; Labella, B.; Fava, L.; Vanuzzo, M. C.; Lisi, V.; Antonello, M.; Grimaldi, C. I.; Zulian, C.; Del Vecchio, C.; Plebani, M.; Padoan, A.; Cirillo, D. M.; Brazzale, A. R.; Tonon, G.; Toppo, S.; Dorigatti, I.; Crisanti, A.
Phylogeography and genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Italy and Europe with newly characterized Italian genomes between February-June 2020
2022 Lai, Alessia; Bergna, Annalisa; Toppo, Stefano; Morganti, Marina; Menzo, Stefano; Ghisetti, Valeria; Bruzzone, Bianca; Codeluppi, Mauro; Fiore, Vito; Rullo, Emmanuele Venanzi; Antonelli, Guido; Sarmati, Loredana; Brindicci, Gaetano; Callegaro, Annapaola; Sagnelli, Caterina; Francisci, Daniela; Vicenti, Ilaria; Miola, Arianna; Tonon, Giovanni; Cirillo, Daniela; Menozzi, Ilaria; Caucci, Sara; Cerutti, Francesco; Orsi, Andrea; Schiavo, Roberta; Babudieri, Sergio; Nunnari, Giuseppe; Mastroianni, Claudio M; Andreoni, Massimo; Monno, Laura; Guarneri, Davide; Coppola, Nicola; Crisanti, Andrea; Galli, Massimo; Zehender, Gianguglielmo
Rapid SARS-CoV-2 Intra-Host and Within-Household Emergence of Novel Haplotypes
2022 Manuto, L.; Grazioli, M.; Spitaleri, A.; Fontana, P.; Bianco, L.; Bertolotti, L.; Bado, M.; Mazzotti, G.; Bianca, F.; Onelia, F.; Lorenzin, G.; Simeoni, F.; Lazarevic, D.; Franchin, E.; Del Vecchio, C.; Dorigatti, I.; Tonon, G.; Cirillo, D. M.; Lavezzo, E.; Crisanti, A.; Toppo, S.
The glutathione peroxidase family: Discoveries and mechanism
2022 Flohe, L.; Toppo, S.; Orian, L.
Vimentin binds to G-quadruplex repeats found at telomeres and gene promoters
2022 Ceschi, Silvia; Berselli, Michele; Cozzaglio, Marta; Giantin, Mery; Toppo, Stefano; Spolaore, Barbara; Sissi, Claudia
Aerobic pyruvate metabolism sensitizes cells to ferroptosis primed by GSH depletion
2021 Vuckovic, A. -M.; Venerando, R.; Tibaldi, E.; Bosello Travain, V.; Roveri, A.; Bordin, L.; Miotto, G.; Cozza, G.; Toppo, S.; Maiorino, M.; Ursini, F.
Author Correction: SARS-CoV-2 antibody dynamics and transmission from community-wide serological testing in the Italian municipality of Vo’ (Nature Communications, (2021), 12, 1, (4383), 10.1038/s41467-021-24622-7)
2021 Dorigatti, I.; Lavezzo, E.; Manuto, L.; Ciavarella, C.; Pacenti, M.; Boldrin, C.; Cattai, M.; Saluzzo, F.; Franchin, E.; Del Vecchio, C.; Caldart, F.; Castelli, G.; Nicoletti, M.; Nieddu, E.; Salvadoretti, E.; Labella, B.; Fava, L.; Guglielmo, S.; Fascina, M.; Grazioli, M.; Alvisi, G.; Vanuzzo, M. C.; Zupo, T.; Calandrin, R.; Lisi, V.; Rossi, L.; Castagliuolo, I.; Merigliano, S.; Unwin, H. J. T.; Plebani, M.; Padoan, A.; Brazzale, A. R.; Toppo, S.; Ferguson, N. M.; Donnelly, C. A.; Crisanti, A.
Author Correction: Suppression of a SARS-CoV-2 outbreak in the Italian municipality of Vo’ (Nature, (2020), 584, 7821, (425-429), 10.1038/s41586-020-2488-1)
2021 Lavezzo, E.; Franchin, E.; Ciavarella, C.; Cuomo-Dannenburg, G.; Barzon, L.; Del Vecchio, C.; Rossi, L.; Manganelli, R.; Loregian, A.; Navarin, N.; Abate, D.; Sciro, M.; Merigliano, S.; De Canale, E.; Vanuzzo, M. C.; Besutti, V.; Saluzzo, F.; Onelia, F.; Pacenti, M.; Parisi, S. G.; Carretta, G.; Donato, D.; Flor, L.; Cocchio, S.; Masi, G.; Sperduti, A.; Cattarino, L.; Salvador, R.; Nicoletti, M.; Caldart, F.; Castelli, G.; Nieddu, E.; Labella, B.; Fava, L.; Drigo, M.; Gaythorpe, K. A. M.; Ainslie, K. E. C.; Baguelin, M.; Bhatt, S.; Boonyasiri, A.; Boyd, O.; Coupland, H. L.; Cucunuba, Z.; Djafaara, B. A.; van Elsland, S. L.; Fitzjohn, R.; Flaxman, S.; Green, W. D.; Hallett, T.; Hamlet, A.; Haw, D.; Imai, N.; Jeffrey, B.; Knock, E.; Laydon, D. J.; Mellan, T.; Mishra, S.; Nedjati-Gilani, G.; Nouvellet, P.; Okell, L. C.; Parag, K. V.; Riley, S.; Thompson, H. A.; Unwin, H. J. T.; Verity, R.; Vollmer, M. A. C.; Walker, P. G. T.; Walters, C. E.; Wang, H.; Wang, Y.; Watson, O. J.; Whittaker, C.; Whittles, L. K.; Xi, X.; Brazzale, A. R.; Toppo, S.; Trevisan, M.; Baldo, V.; Donnelly, C. A.; Ferguson, N. M.; Dorigatti, I.; Crisanti, A.
SARS-CoV-2 antibody dynamics and transmission from community-wide serological testing in the Italian municipality of Vo'
2021 Dorigatti, Ilaria; Lavezzo, Enrico; Manuto, Laura; Ciavarella, Constanze; Pacenti, Monia; Boldrin, Caterina; Cattai, Margherita; Saluzzo, Francesca; Franchin, Elisa; Del Vecchio, Claudia; Caldart, Federico; Castelli, Gioele; Nicoletti, Michele; Nieddu, Eleonora; Salvadoretti, Elisa; Labella, Beatrice; Fava, Ludovico; Guglielmo, Simone; Fascina, Mariateresa; Grazioli, Marco; Alvisi, Gualtiero; Vanuzzo, Maria Cristina; Zupo, Tiziano; Calandrin, Reginetta; Lisi, Vittoria; Rossi, Lucia; Castagliuolo, Ignazio; Merigliano, Stefano; Unwin, H Juliette T; Plebani, Mario; Padoan, Andrea; Brazzale, Alessandra R; Toppo, Stefano; Ferguson, Neil M; Donnelly, Christl A; Crisanti, Andrea
Copper/Zinc Superoxide Dismutase from the Crocodile Icefish Chionodraco hamatus: Antioxidant Defense at Constant Sub-Zero Temperature
2020 Chatzidimitriou, E.; Bisaccia, P.; Corrà, F.; Bonato, M.; Irato, P.; Manuto, L.; Toppo, S.; Bakiu, R.; Santovito, G.