Structural and functional study of Helicobacter pylori proteins contributing to stomach colonization

Three H. pylori proteins contributing to stomach colonization have been chosen to be structurally characterized: Fur, Hp1454, and HypB. The first one, which is a Fe-dependent transcription regulator was expressed and purified. Unfortunately. after the crystallization test started, the crystal structure of Fur was published by another group. Hp1454 is a secreted protein of unknown function. It has been purified, expressed and crystallized. Since it lacks any sequence similarity with other proteins of known structure, Se-Met derivatives were produced and the structure determined. A function for the protein has been also proposed, based on the study of Hp1454 interaction network. The GTPase HypB is an essential factor for maturation of H. pylori’s hydrogenase and urease. It was cloned, expressed and purified and preliminary crystallization tests performed.

Tre proteine di H. pylori che rivestono un importante ruolo nella colonizzazione dello stomaco sono state scelte per essere caratterizzate strutturalmente: Fur, Hp1454 e HypB. La prima, un regolatore trascrizionale ferro-dipendente, è stata espressa e purificata. Purtroppo, dopo i primi test di cristallizzazione, la struttura di Fur è stata pubblicata da un altro gruppo. Hp1454 è una proteina secreta la cui funzione è sconosciuta. Hp1454 é stata purificata, espressa e cristallizzata. Poichè la proteina non presenta omologia di sequenza con altre proteine di struttura nota, sono stati prodotti derivati di Se-Met e la struttura è stata quindi determinata. Una funzione per la proteina è stata inoltre proposta sulla base degli studi di interazione tra Hp1454 e altre proteine. La GTPasi HypB è un essenziale fattore nella maturazione dell' idrogenasi e dell' ureasi di pylori. La proteina è stata clonata e purificata e sono stati effettuate delle prove preliminari di cristallizzazione.