La ricombinazione tra differenti stipiti del virus della PRRSV è stata riportata sia in vitro sia in vivo. Ciononostante evidenze di ricombinazione da studi di campo sono rare e principalmente ottenute dalla comparazione di sequenze da campionamenti su larga scala. Questo studio è rivolto ad indagare questo fenomeno su piccola scala usando 162 campioni ottenuti da suini di allevamenti di tre regioni del Nord Italia e raccolti tra il 2009 e il 2012. È stata evidente la predizione di tre eventi di ricombinazione. Due mostravano almeno un breakpoint nella regione non sequenziata tra ORF5 e ORF7, il terzo evento comprendeva la regione di ORF5 includendo parte del maggiore epitopo di neutralizzazione. L’identificazione a distanza di tempo degli stessi stipiti ricombinanti nella medesima azienda depone a favore di una loro significativa fitness.
Studi di epidemiologia molecolare in allevamenti del Nord Italia: evidenza di ricombinazione
DRIGO, MICHELE;FRANZO, GIOVANNI;CECCHINATO, MATTIA;PASOTTO, DANIELA;MENANDRO, MARIA LUISA;MARTINI, MARCO
2013
Abstract
La ricombinazione tra differenti stipiti del virus della PRRSV è stata riportata sia in vitro sia in vivo. Ciononostante evidenze di ricombinazione da studi di campo sono rare e principalmente ottenute dalla comparazione di sequenze da campionamenti su larga scala. Questo studio è rivolto ad indagare questo fenomeno su piccola scala usando 162 campioni ottenuti da suini di allevamenti di tre regioni del Nord Italia e raccolti tra il 2009 e il 2012. È stata evidente la predizione di tre eventi di ricombinazione. Due mostravano almeno un breakpoint nella regione non sequenziata tra ORF5 e ORF7, il terzo evento comprendeva la regione di ORF5 includendo parte del maggiore epitopo di neutralizzazione. L’identificazione a distanza di tempo degli stessi stipiti ricombinanti nella medesima azienda depone a favore di una loro significativa fitness.
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